Glucolisis

Glucolisis, nueva producción de los geniales y aclamados chicos de Rap Medicina



Glucolisis

Se te complica aprenderte esta cosa
Principal ruta para el metabolismo e´ la glucosa
Ya sé, que estoy con expertos y no novatos
Y que el producto terminal de esta vía es el Piruvato

Glucólisis en toda las células transcurre
En el citosol de ellas ocurre
Pero ya! no te rompas el coco, ni pierdas el foco
Un poco, de rap medicina pa´ que no te vuelvas loco

La glucosa a la célula hace su entrada
Por fosforilación ha sido modificada
Y cómo será llamada?
Será glucosa 6 fosfato, en este paso así será nombrada

Y cuál es la enzima utilizada?,
Bueno, va depender de la célula visitada
Tenemos la glucoquinasa y la hexoquinasa en esto
Y esta última para todas las células excepto

Células betas del páncreas y los hepatocitos
Que en este caso a la glucoquinasa necesito
Y en esta reacción como escucha usted
Se consume un ATP y genera ADP

Y la glucosa 6 fosfato
Pasa a fructosa 6 fosfato
Y la enzima, la que hizo esto
Se llama isomerasa te lo manifiesto

Esa fructosa 6 fosfato ya verás
Que en fructosa 1,6 bifosfato se convertirá
Y la fosfofructoquinasa I hará
Que por fosforilación esto a cabo se llevará

Esto consume otro ATP, genera otro ADP
Y pal´ examen hago un RAP
Y la fructosa 1,6 bifosfato
Se divide en dos, en dos triosa fosfato

Uno, en Gliceraldehido 3 fosfato
Dos, en Dihidroxiacetona fosfato
Reacción que por la aldolasa es catalizada
Glucólisis lesión cantada, jamás olvidada

La Dihidroxiacetona viene
Para continuar en la cadena hace lo que le conviene
En Gliceraldehido 3 fosfato se transforma
Se isomeriza para seguir de esta forma

En Gliceraldehido 3 fosfatos, y ya tenemos dos
De Gliceraldehido 3 fosfatos, tenemos dos
Gliceraldehido 3 fosfatos, ahora tenemos dos
Gliceraldehido 3 fosfatos, ya son dos

Por ende, a partir de aquí le aclaro mi gente
Son dos, iguales reacciones simultáneamente
Los Gliceraldehidos 3 fosfatos se oxidaron
Y NADH generaron

A glicerato 1,3 bifosfato pasaron
Y fue por la enzima que utilizaron
Gliceraldehido 3 fosfato deshidrogenasa
Óyelo en el bus, apréndetelo en la casa

El glicerato 1,3 bifosfato
Ahora es glicerato 3 fosfato
Y la enzima es una quinasa
Entra un ADP y el primer ATP se saca

La fosfoglicerato quinasa lo provocó
Cuando glicerato 3 fosfato se colocó
Por la enzima mutasa que tocó
Y sacó, el glicerato 2 fosfato que se destacó

El glicerato 2 fosfato se deshidrata
Intervención grata, por la enzima enolasa
Qué pasa?, este elemento sale de inmediato
Y se conoce como, fosfoenol piruvato

En este último hay una enzima clave
La piruvato quinasa tiene la llave
Y algo en el transcurso que me percaté
Toda enzima quinasa me produce un ATP

Y hace su entrada el anhelado candidato
Este producto terminal que es el piruvato
Y cuál es la ganancia neta según el relato?
2 ATP, 2 NADH y 2 Piruvato

Nota: pa´ que lo pongas en la esquina e´ la mascota
Vakan se te va olvidar si no lo anotas
Si el Piruvato se oxida, adivina qué?
Entra a la mitocondria y luego pal´ Ciclo de Krebs

En cambio, anaeróbicamente un proceso táctico
Fermenta el Piruvato y lo convierte en Acido Láctico
Ya no te compliques pues te traje la solución
Páginas pa´ la izquierda complementado con la canción.

Rap Medicina

Cantautor: R4
Composición: R4
Instrumental: Doble D

Estudio del efecto del factor de crecimiento insulínico-1 (IGF-1) sobre células de mamífero en cultivo

Castillejo-Borrego, A.; Castro-Porras, C.; Gil-Orozco, A.; Gómez-Fernández, M.; Román-Cabezas, M.; Zaya, J.M.; Santamaría, R.; del Pino, J.A.; Rico-Llanos, G.A.; Visser, R. (2017):
"Estudio del efecto del factor de crecimiento insulínico-1 (IGF-1) sobre células de mamífero en cultivo." Journal Science IES, 2(1), p.22-33 .

El trabajo puede consultarse (y descargarse si hace falta) directamente en el siguiente enlace. de la revista on line que la publica, la Journal Science IES.

Este trabajo de investigación ha sido realizado por alumnas de nuestro IES, en colaboración con alumnos del IES Escultor Marín Higuero de Arriate y del Colegio Patrocinio San José de Estepona.
Durante el mismo se visitaron y se hizo uso de los medios e instalaciones que generosamente fueron puestas a disposición del proyecto por parte del Departamento de Biología Celular, Genética y Fisiología del BIONAND, Universidad de Málaga.

Mixos

Mixos, mixomicetes, hongos mucilaginosos plasmodiales.
Un par de representantes que podemos encontrar por estas tierras:

Este primero, de un amarillo muy llamativo, podría tratarse de Leocarpus fragilis.

De este segundo aún no me he puesto a averiguar su nombre.

Un día en la vida de una (sufrida) proteína motora celular

Un recomendable vídeo que combina rigor y humor.
Se puede activar la opción de subtítulos, en inglés, de manera que podamos seguir los trabajos de John, una activa y simpática proteína motora.
"Hoogenraad lab at the Utrecht University" . Website at http://cellbiology.science.uu.nl.

Comederos para pájaros

Ahora que llega, por fin, el crudo invierno, la comida escasea en el monte y no es mala idea ayudar a los pobres pajarillos a pasar esta fría estación. En los vídeos que se muestran a continuación, realizados por Carlos de Hita y colgados en su blog, Carlos de Hita El sonido de la naturaleza, y en su canal de youtube, se muestran unos cuantos modelos de comederos, desde los más rústicos a los más elaborados. También los vídeos (minidocumentales, en realidad) nos enseñan qué nos pueden dar a cambio, si ponemos un poco de empeño, paciencia y observación, estos simpáticos seres alados.

Esencialidad

 El término esencial en biología presenta un matiz que en lenguaje coloquial quizás no se aprecie debidamente. Cuando en biología hablamos de un nutriente esencial no significa solamente que es muy importante, sino que lo es porque tenemos que incluirlo obligatoriamente en nuestra dieta ya que nuestro organismo no sabe fabricarlo, o lo hace en tan mínimas cantidades que debemos suplementar con la dieta todo lo que nos falta hasta alcanzar el mínimo requerido para vivir sin padecer trastornos y anomalías metabólicas. Estos trastornos y anomalías se engloban dentro de lo que se conoce como enfermedades carenciales.

La esencialidad en el ser humano podemos decir que es de tipo transversal puesto que afecta a diferentes tipos de bioelementos y biomoléculas. Necesitamos comer determinados ácidos grasos, determinados isoprenoides, determinados aminoácidos, determinados compuestos precursores de nucleótidos. 

Dentro de los bioelementos se han señalado los oligoelementos como elementos críticos para la supervivencia que debemos adquirir en la dieta aún cuando sólo precise de cantidades practicamente insignificantes.

Según la wikipedia, en el ser humano solamente tenemos dos ácidos grasos esenciales, el α-linolénico (18:3ω-3) y el linoleico (18:2ω-6). A partir de ellos podemos fabricar el resto de ácidos graos poliinsaturados. Algunos autores añaden a esta escueta lista al ácido araquidónico, precursor de los eicosanoides, porque, aunque no lo sea estrictamente, puede volverse esencial si existe deficiencia en el aporte de linoleico o si existe incapacidad para convertir el linoleico en araquidónico.

En el grupo de los aminoácidos, tradicionalemente se habían reconocido ocho aminoácidos  (fenilalanina, valina, treonina, triptófano, metionina, leucina, isoleucina, lisina) claramente esenciales para el ser humano, aunque actualmente se tiende a añadir a la lista un noveno aminoácido, la histidina.

Las vitaminas son, por definición, sustancias esenciales, que debemos incorporar en la dieta puesto que el organismo no sabe fabricarlas. Son de naturaleza química heterogénea y su clasificación hace más referencia a su actividad biológica o química y no por su estructura. Se separan en hidrosolubles y liposolubles. La ausencia en la dieta de determinadas vitaminas da lugar a enfermedades carenciales o avitaminosis conocidas desde antiguo (así la B1 con el beri beri o la vitamina C con el escorbuto) , más o menos reversibles con el aporte de la vitamina ausente en la dieta, pero también pueden ser causantes de trastornos en el desarrollo que se sufrirá toda la vida. Así, la deficiencia de ácido fólico (vitamina B9) en embarazadas puede dar lugar a procesos de espina bífida en el feto.

Otra cosa distinta es lo que nos presenta el magnífico vídeo introductorio. En este caso la Venus Atrapamoscas (Dioanea muscipula) no es que no sepa fabricar determinados compuestos químicos y los tenga que adquirir de las pobres moscas que captura. En este caso se ha producido un bonito proceso evolutivo que permite a estas especies prosperar en medios con suelos muy pobres compensando esta carencia nutritiva con el aporte de nutrientes que pueden obtener mediante la captura en sus trampas de pequeños insectos. Si las condiciones del medio cambiasen no les sería necesario recurrir a sus costumbres cazadoras y se contentarían con lo que el suelo les ofrece. Esto fácilmente se puede comprobar cultivando en casa uno de estos ejemplares con un poquito de suplemento nutritivo (muy justito; puede resultar muy fácil "envenenarlas" por exceso de comida). Lo que les proporciona ventaja adaptativa es poder colonizar medios de pobreza nutritiva extrema donde otras plantas no podrían prosperar o lo harían de forma muy penosa.

La importancia del Carbono y la Química en BB

Temporada 2, episodio 6. Recorte del capítulo con fines didácticos.

El recorte está subtitulado en español, aunque quizá hubiera sido necesario un asesor para ciertos términos químicos. En todo caso, el profesor Walter White (que aún no había cogido las maneras de Heisenberg) tiene una exquisita pronunciación y al cabo de un par de visionados (para los más lentos en entender inglés, entre los que me encuentro) se le entiende bastante bien.
Sobre H. Tracy Hall, al que se menciona en el vídeo como el primer investigador que consiguió la fabricación de diamantes sintéticos, allá por la década de los '50, se puede consultar esta entrada de la wikipedia.

Respecto a Breaking Bad, he encontrado una web, Triple Enlace, que analiza el cómo se manejan determinados conceptos sobre Química (y Bioquímica) en la serie.

Enlazo con esta serie de interesantes artículos:

La química de Breaking Bad – 0: Introducción (por Denís Paredes)
La química de Breaking Bad – 1: ¿Puede el ácido fluorhídrico disolver un cadáver?
La química de Breaking Bad – 2: El verdadero poder explosivo del fulminato de mercurio
La química de Breaking Bad – 3: Pila de mercurio
La química de Breaking Bad – 4: Fuegos de colores
La química de Breaking Bad – 5: Cocinando cristal
La química de Breaking Bad – 6: Composición del cuerpo humano (por L. E. Castillero)
La química de Breaking Bad – 7: Ricina


He remarcado los dos últimos porque me parecen más interesantes desde un punto de vista biológico.

En el caso de la composición del cuerpo humano (que guarda bastante relación con el tema de los Biolementos que vimos al inicio de curso), los autores del artículo señalan la excesiva licencia que se tomaron los guionistas al construir un diálogo para conseguir un determinado efecto dramático saltándose una serie de importantes decimales y biolementos por el camino.

En el caso de la ricina, los autores remarcan la peligrosidad de esta sustancia, un poderoso veneno, sin duda, pero también señalan que la advertencia que Walter hace a Jesse resulta como mínimo, un poco exagerada: las semillas de ricino se pueden tocar y no te vas a morir si lo haces. Cosa distinta, aclaro, es si te da por ingerir un puñado de ellas, masticarlas y tragártelas. Ahí sí que tendríamos un serio problema.

(Por si falla el vídeo incrustrado, este es el enlace al vídeo en youtube )